Vào tối ngày 14 tháng 10, tổng thống Erdoğan và vua Salman tuyên bố, 2 bên đã thỏa thuận lập một nhóm điều tra chung để xem xét vụ này [51] Vào ngày 15 tháng 10, một cuộc khám xét tòa lãnh sự bởi cả viên chức Thổ Nhĩ Kỳ và Ả Rập Xê Út xảy ra kéo dài 9 tiếng.[73][91][92] Tổng thống Thổ Nhĩ Kỳ Recep Tayyip Erdogan nói rằng một số chất độc trong lãnh sự quán đã được sơn lấp lên trước khi các nhà điều tra có thể vào lãnh sự quán.[93]Ngày 17.10, bộ trưởng Nội vụ Thổ Süleyman Soylu cho biết ông biết về số phận của Khashoggi, tuy nhiên quần chúng nên kiên nhẫn chờ kết quả của ban điều tra. Bộ trưởng bộ Ngoại giao cho biết danh thự của lãnh sự Ả Rập Xê Út chưa bị khám xét và hy vọng cảnh sát có thể bắt đầu hôm nay.[94] Chiều ngày 17.10 cảnh sát Thổ đã vào khám xét biệt thự lãnh sự Ả Rập Xê Út, sau khi lãnh sự al-Otaibi về nước ngày hôm trước.[56] Tại đây, các chuyên gia pháp y Thổ Nhĩ Kỳ đã tìm thấy "các mẫu giống với những mẫu không dấu được" tại lãnh sự quán Saudi, cung cấp, theo văn phòng của tổng công tố viên "thêm bằng chứng về kết luận rằng Jamal Khashoggi đã bị giết trong tòa nhà lãnh sự".[95]

Trong khi đó, một nhóm các tổ chức nhân quyền đòi hỏi một cuộc điều tra của LHQ về sự biến mất của Jamal Khashoggi. Đây là "bảo đảm tốt nhất chống lại sự che lấp của Ả Rập Xê Út", ông Robert Mahoney, giám đốc của Ủy ban bảo vệ nhà báo ngày 18.10 cho biết. Đại diện của Tổ chức Ân xá Quốc tế, Tổ chức Theo dõi Nhân quyền và Phóng viên Không Biên giới cũng cùng ý kiến.[96]

Lãnh sự tự do về nước

Một ngày trước khi biệt thự của lãnh sự al-Otaibi bị khám xét, ông này đã về nước mà không bị cảnh sát Thổ Nhĩ Kỳ thẩm vấn. Phát ngôn viên đảng cầm quyền AKP cho là vì al-Otaibi được miễn trừ ngoại giao cho nên không thể ngăn cản ông ta được. Durmuş Tezcan, chuyên gia về luật quốc tế của Đại học Cận đông Istanbul, cho rằng trong trường hợp có nghi ngờ mạnh mẽ về tội phạm nghiêm trọng, các nhân viên lãnh sự ngoại quốc có thể bị tạm giam để thẩm vấn. Vì vậy theo ông, cuộc điều tra này nặng tính chính trị hơn là thuần túy pháp lý.[97]

Ả Rập Xê Út thừa nhận cái chết

Ngày 19 tháng 10 năm 2018, Chính phủ Ả Rập Xê Út thừa nhận là ông đã bị đánh chết trong tòa lãnh sự sau cuộc điều tra khởi đầu và cho sa thải 5 quan chức hàng đầu và tạm giam 18 người Ả Rập Xê Út khác. Những người bị sa thải là Saud al-Qahtani cố vấn của MBS, phó giám đốc cơ quan tình báo Ahmed al-Assiri, thiếu tướng Mohammed bin Saleh al-Rumaih phó giám đốc ban điều hành tổng tình báo, thiếu tướng Abdullah bin Khalifa al-Shaya giám đốc tổng tình báo về nhân lực và tướng Rashad bin Hamed al-Mohammad giám đốc ban điều hành về an ninh và bảo vệ.[7]